中科院南通光电工程中心成立于2011年12月，是南通市人民政府与中国科学院上海微系统与信息技术研究所合作共建的科技研发机构，是实行企业化运作的事业法人单位。中心依托中国科学院上海微系统与信息技术研究所雄厚的研发力量、人才优势和综合技术实力，开展以光电集成、集成电路特色产品及工艺等相关技术的研究，中心将致力于建设成为国内领先、国际一流、特点突出、高端科研人才汇聚的光电技术产业创新基地。
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